Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAX1Q5SQQ9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAX1Q5SQQ9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms