Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ70

SPDYA, Speedy protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYAQ5MJ70 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPDYAQ5MJ70 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPDYAQ5MJ70 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPDYAQ5MJ70 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPDYAQ5MJ70 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPDYAQ5MJ70 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPDYAQ5MJ70 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPDYAQ5MJ70 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPDYAQ5MJ70 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPDYAQ5MJ70 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPDYAQ5MJ70 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPDYAQ5MJ70 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPDYAQ5MJ70 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPDYAQ5MJ70 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153 ms