Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGO1Q5FBB7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGO1Q5FBB7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGO1Q5FBB7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms