Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf116Q5BN46 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf116Q5BN46 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms