Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD39Q53RE8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD39Q53RE8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms