Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL12Q53G59 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL12Q53G59 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL12Q53G59 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms