Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC23Q53EV4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC23Q53EV4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC23Q53EV4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC23Q53EV4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms