Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN52Q52LA3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN52Q52LA3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIN52Q52LA3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms