Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf46Q504U0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C4orf46Q504U0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms