Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DNAL1Q4LDG9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAL1Q4LDG9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAL1Q4LDG9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms