Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF260Q3ZCT1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF260Q3ZCT1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF260Q3ZCT1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF260Q3ZCT1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF260Q3ZCT1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF260Q3ZCT1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF260Q3ZCT1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF260Q3ZCT1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF260Q3ZCT1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF260Q3ZCT1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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