Protein–RNA interactions for Protein: Q32M88

PGGHG, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGHGQ32M88 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGGHGQ32M88 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGGHGQ32M88 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGGHGQ32M88 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms