Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VMACQ2NL98 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VMACQ2NL98 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VMACQ2NL98 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VMACQ2NL98 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms