Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPRED3Q2MJR0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPRED3Q2MJR0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms