Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q1T7F1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q1T7F1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q1T7F1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q1T7F1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q1T7F1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q1T7F1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q1T7F1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q1T7F1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q1T7F1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q1T7F1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q1T7F1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q1T7F1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q1T7F1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q1T7F1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q1T7F1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q1T7F1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q1T7F1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q1T7F1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q1T7F1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q1T7F1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q1T7F1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q1T7F1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q1T7F1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q1T7F1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q1T7F1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q1T7F1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q1T7F1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q1T7F1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q1T7F1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q1T7F1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q1T7F1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q1T7F1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q1T7F1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q1T7F1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q1T7F1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q1T7F1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q1T7F1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q1T7F1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q1T7F1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q1T7F1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q1T7F1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q1T7F1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q1T7F1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q1T7F1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Q1T7F1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q1T7F1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q1T7F1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q1T7F1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q1T7F1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Q1T7F1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q1T7F1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q1T7F1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Q1T7F1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q1T7F1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q1T7F1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q1T7F1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q1T7F1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q1T7F1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q1T7F1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Q1T7F1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q1T7F1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q1T7F1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q1T7F1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q1T7F1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q1T7F1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q1T7F1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q1T7F1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q1T7F1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q1T7F1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q1T7F1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q1T7F1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q1T7F1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q1T7F1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q1T7F1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q1T7F1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q1T7F1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q1T7F1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q1T7F1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q1T7F1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q1T7F1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q1T7F1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q1T7F1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q1T7F1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q1T7F1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q1T7F1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q1T7F1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q1T7F1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q1T7F1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q1T7F1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q1T7F1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q1T7F1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q1T7F1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q1T7F1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q1T7F1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q1T7F1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q1T7F1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q1T7F1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q1T7F1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q1T7F1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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