Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCK2Q16822 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCK2Q16822 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PCK2Q16822 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCK2Q16822 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCK2Q16822 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCK2Q16822 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCK2Q16822 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCK2Q16822 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCK2Q16822 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCK2Q16822 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCK2Q16822 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCK2Q16822 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCK2Q16822 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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