Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGISQ16647 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTGISQ16647 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTGISQ16647 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTGISQ16647 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms