Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 TACC1-212ENST00000521050 491 ntTSL 1 (best)13.03□□□□□ -0.327e-7■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TACC1-216ENST00000521642 493 ntTSL 1 (best)12.31□□□□□ -0.447e-7■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TACC1-222ENST00000522752 944 ntTSL 1 (best)11.18□□□□□ -0.627e-7■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.667e-7■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TACC1-223ENST00000522904 1724 ntTSL 510.78□□□□□ -0.687e-7■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TACC1-204ENST00000518415 3011 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.037e-7■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.257e-7■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.257e-7■■■■□ 21.1
SRSF7Q16629 TPCN2-204ENST00000535009 2175 ntTSL 219.24■□□□□ 0.672e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 PSPC1-204ENST00000492741 1709 ntTSL 218.29■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 RNH1-217ENST00000529768 1019 ntTSL 217.86■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.398e-12■■■■□ 21
SRSF7Q16629 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.352e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 RNH1-210ENST00000525701 1794 ntTSL 516.98■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 ASL-202ENST00000362000 928 ntTSL 216.36■□□□□ 0.218e-12■■■■□ 21
SRSF7Q16629 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 PSPC1-203ENST00000471658 1647 ntTSL 1 (best)15.79■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 PDXK-212ENST00000470029 583 ntTSL 315.49■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.038e-12■■■■□ 21
SRSF7Q16629 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 ETV4-206ENST00000585508 760 ntTSL 515.1■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 RNH1-207ENST00000524464 624 ntTSL 514.85□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.078e-12■■■■□ 21
SRSF7Q16629 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.238e-12■■■■□ 21
SRSF7Q16629 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 TBC1D8-205ENST00000473937 1093 ntTSL 212.4□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 ETV4-210ENST00000590236 616 ntTSL 312.2□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 TPCN2-206ENST00000635811 3824 ntTSL 511.96□□□□□ -0.52e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 ETV4-209ENST00000587151 582 ntTSL 511.07□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 RNH1-209ENST00000525522 3281 ntTSL 1 (best)10.82□□□□□ -0.682e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 TBC1D8-201ENST00000376840 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.72e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.752e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 TPCN2-202ENST00000442692 4376 ntTSL 210□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 PDXK-207ENST00000438837 342 ntTSL 36.86□□□□□ -1.312e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 RERE-211ENST00000469251 355 ntTSL 32.98□□□□□ -1.932e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 PSPC1-208ENST00000635562 422 ntTSL 32.89□□□□□ -1.952e-6■■■■□ 21
SRSF7Q16629 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.08□□□□□ -2.082e-77■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.373e-7■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 BRD9-212ENST00000495265 2843 ntTSL 215.06■□□□□ 03e-7■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 BRD9-208ENST00000489816 3170 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.33e-7■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 BRD9-201ENST00000466684 1417 ntTSL 212.54□□□□□ -0.43e-7■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 BRD9-213ENST00000495794 4865 ntTSL 211.62□□□□□ -0.553e-7■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 BRD9-218ENST00000519838 396 ntTSL 210.74□□□□□ -0.693e-7■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 BRD9-204ENST00000483173 2120 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.713e-7■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 BRD9-203ENST00000475706 744 ntTSL 1 (best)9.15□□□□□ -0.943e-7■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 BRD9-209ENST00000490814 3477 ntTSL 1 (best)8.5□□□□□ -1.053e-7■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 BRD9-211ENST00000494422 449 ntTSL 35.29□□□□□ -1.563e-7■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 C3-218ENST00000602229 585 ntTSL 28.96□□□□□ -0.981e-7■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 C3-212ENST00000599899 1992 ntTSL 27.57□□□□□ -1.21e-7■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 C3-211ENST00000599668 627 ntTSL 36.91□□□□□ -1.31e-7■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 C3-215ENST00000601008 303 ntTSL 56.61□□□□□ -1.351e-7■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 PTPRF-206ENST00000429895 6312 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.364e-7■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 PTPRF-205ENST00000414879 4836 ntTSL 210.2□□□□□ -0.784e-7■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 PTPRF-204ENST00000412568 4154 ntTSL 59.23□□□□□ -0.934e-7■■■■□ 20.9
SRSF7Q16629 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.046e-8■■■■□ 20.8
SRSF7Q16629 SNTB1-203ENST00000519177 1962 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.156e-8■■■■□ 20.8
SRSF7Q16629 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.076e-8■■■■□ 20.8
SRSF7Q16629 TRAF7-206ENST00000569686 586 ntTSL 220.69■□□□□ 0.94e-7■■■■□ 20.8
SRSF7Q16629 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.434e-7■■■■□ 20.8
SRSF7Q16629 TRAF7-202ENST00000564067 874 ntTSL 313.74□□□□□ -0.214e-7■■■■□ 20.8
SRSF7Q16629 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.214e-7■■■■□ 20.8
SRSF7Q16629 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.364e-7■■■■□ 20.8
SRSF7Q16629 TRAF7-204ENST00000567645 737 ntTSL 511.44□□□□□ -0.584e-7■■■■□ 20.8
SRSF7Q16629 PTPRS-206ENST00000588552 5443 ntTSL 1 (best)12.9□□□□□ -0.353e-6■■■■□ 20.8
SRSF7Q16629 TVP23C-CDRT4-204ENST00000557349 1005 ntTSL 213.32□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 20.8
SRSF7Q16629 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 20.8
SRSF7Q16629 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.841e-6■■■■□ 20.8
SRSF7Q16629 CDRT4-203ENST00000524205 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 28.23□□□□□ -1.091e-6■■■■□ 20.8
SRSF7Q16629 TVP23C-CDRT4-201ENST00000481756 556 ntTSL 44.79□□□□□ -1.641e-6■■■■□ 20.8
SRSF7Q16629 CDRT4-202ENST00000520956 470 ntTSL 42.77□□□□□ -1.971e-6■■■■□ 20.8
SRSF7Q16629 TVP23C-CDRT4-202ENST00000518506 520 ntTSL 52.04□□□□□ -2.081e-6■■■■□ 20.8
SRSF7Q16629 BAG6-250ENST00000451898 993 ntTSL 314.51□□□□□ -0.093e-17■■■■□ 20.7
SRSF7Q16629 BAG6-248ENST00000441054 654 ntTSL 314.2□□□□□ -0.143e-17■■■■□ 20.7
SRSF7Q16629 BAG6-245ENST00000437771 2407 ntTSL 513.33□□□□□ -0.273e-17■■■■□ 20.7
SRSF7Q16629 BAG6-240ENST00000424480 1056 ntTSL 212.87□□□□□ -0.353e-17■■■■□ 20.7
SRSF7Q16629 BAG6-244ENST00000435080 1710 ntTSL 512.12□□□□□ -0.473e-17■■■■□ 20.7
SRSF7Q16629 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.73e-17■■■■□ 20.7
SRSF7Q16629 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.783e-17■■■■□ 20.7
SRSF7Q16629 BAG6-255ENST00000456622 859 ntTSL 59.99□□□□□ -0.813e-17■■■■□ 20.7
SRSF7Q16629 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.863e-17■■■■□ 20.7
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