Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LY6EQ16553 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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LY6EQ16553 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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LY6EQ16553 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LY6EQ16553 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LY6EQ16553 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LY6EQ16553 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LY6EQ16553 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LY6EQ16553 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LY6EQ16553 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LY6EQ16553 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LY6EQ16553 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LY6EQ16553 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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