Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAPC1Q16533 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAPC1Q16533 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAPC1Q16533 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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