Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USF2Q15853 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USF2Q15853 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USF2Q15853 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USF2Q15853 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USF2Q15853 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USF2Q15853 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
USF2Q15853 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USF2Q15853 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USF2Q15853 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USF2Q15853 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USF2Q15853 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USF2Q15853 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USF2Q15853 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USF2Q15853 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USF2Q15853 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
USF2Q15853 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USF2Q15853 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
USF2Q15853 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USF2Q15853 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USF2Q15853 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USF2Q15853 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USF2Q15853 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
USF2Q15853 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
USF2Q15853 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USF2Q15853 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USF2Q15853 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USF2Q15853 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USF2Q15853 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
USF2Q15853 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
USF2Q15853 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USF2Q15853 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USF2Q15853 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
USF2Q15853 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
USF2Q15853 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
USF2Q15853 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USF2Q15853 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USF2Q15853 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USF2Q15853 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USF2Q15853 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USF2Q15853 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
USF2Q15853 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
USF2Q15853 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USF2Q15853 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USF2Q15853 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USF2Q15853 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USF2Q15853 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USF2Q15853 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
USF2Q15853 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USF2Q15853 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
USF2Q15853 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USF2Q15853 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
USF2Q15853 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USF2Q15853 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USF2Q15853 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
USF2Q15853 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USF2Q15853 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USF2Q15853 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USF2Q15853 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USF2Q15853 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USF2Q15853 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USF2Q15853 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USF2Q15853 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USF2Q15853 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USF2Q15853 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USF2Q15853 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USF2Q15853 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USF2Q15853 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USF2Q15853 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USF2Q15853 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USF2Q15853 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USF2Q15853 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USF2Q15853 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USF2Q15853 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USF2Q15853 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USF2Q15853 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USF2Q15853 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USF2Q15853 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USF2Q15853 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USF2Q15853 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
USF2Q15853 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USF2Q15853 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
USF2Q15853 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
USF2Q15853 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
USF2Q15853 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USF2Q15853 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USF2Q15853 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USF2Q15853 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USF2Q15853 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USF2Q15853 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USF2Q15853 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USF2Q15853 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USF2Q15853 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USF2Q15853 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USF2Q15853 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USF2Q15853 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USF2Q15853 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USF2Q15853 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USF2Q15853 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USF2Q15853 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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