Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPTX1Q15818 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPTX1Q15818 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPTX1Q15818 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms