Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NCAPHQ15003 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPHQ15003 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NCAPHQ15003 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
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