Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IRF3Q14653 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
IRF3Q14653 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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