Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM29Q14134 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM29Q14134 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM29Q14134 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM29Q14134 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms