Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NID2Q14112 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NID2Q14112 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NID2Q14112 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NID2Q14112 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NID2Q14112 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NID2Q14112 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NID2Q14112 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NID2Q14112 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NID2Q14112 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NID2Q14112 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NID2Q14112 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NID2Q14112 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NID2Q14112 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NID2Q14112 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NID2Q14112 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NID2Q14112 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NID2Q14112 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NID2Q14112 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NID2Q14112 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NID2Q14112 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NID2Q14112 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NID2Q14112 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NID2Q14112 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NID2Q14112 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NID2Q14112 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NID2Q14112 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NID2Q14112 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NID2Q14112 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NID2Q14112 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NID2Q14112 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NID2Q14112 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NID2Q14112 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NID2Q14112 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NID2Q14112 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NID2Q14112 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NID2Q14112 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NID2Q14112 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NID2Q14112 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NID2Q14112 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NID2Q14112 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NID2Q14112 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NID2Q14112 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NID2Q14112 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NID2Q14112 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NID2Q14112 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NID2Q14112 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NID2Q14112 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NID2Q14112 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NID2Q14112 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NID2Q14112 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NID2Q14112 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NID2Q14112 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NID2Q14112 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NID2Q14112 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NID2Q14112 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NID2Q14112 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NID2Q14112 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NID2Q14112 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NID2Q14112 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NID2Q14112 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NID2Q14112 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NID2Q14112 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NID2Q14112 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NID2Q14112 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NID2Q14112 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NID2Q14112 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NID2Q14112 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NID2Q14112 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NID2Q14112 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NID2Q14112 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NID2Q14112 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NID2Q14112 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NID2Q14112 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NID2Q14112 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NID2Q14112 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NID2Q14112 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NID2Q14112 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NID2Q14112 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NID2Q14112 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NID2Q14112 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NID2Q14112 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NID2Q14112 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NID2Q14112 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NID2Q14112 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NID2Q14112 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NID2Q14112 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NID2Q14112 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NID2Q14112 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NID2Q14112 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NID2Q14112 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NID2Q14112 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NID2Q14112 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NID2Q14112 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NID2Q14112 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NID2Q14112 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NID2Q14112 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NID2Q14112 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NID2Q14112 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NID2Q14112 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
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