Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP1A4Q13733 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP1A4Q13733 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
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