Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRQ13535 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRQ13535 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRQ13535 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRQ13535 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRQ13535 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ATRQ13535 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRQ13535 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRQ13535 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATRQ13535 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATRQ13535 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATRQ13535 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATRQ13535 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATRQ13535 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATRQ13535 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATRQ13535 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATRQ13535 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATRQ13535 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATRQ13535 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATRQ13535 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATRQ13535 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATRQ13535 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATRQ13535 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ATRQ13535 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATRQ13535 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATRQ13535 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATRQ13535 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATRQ13535 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATRQ13535 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATRQ13535 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATRQ13535 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATRQ13535 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATRQ13535 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATRQ13535 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATRQ13535 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATRQ13535 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATRQ13535 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATRQ13535 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATRQ13535 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATRQ13535 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATRQ13535 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATRQ13535 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATRQ13535 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATRQ13535 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATRQ13535 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATRQ13535 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATRQ13535 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRQ13535 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRQ13535 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRQ13535 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRQ13535 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRQ13535 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRQ13535 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRQ13535 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATRQ13535 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ATRQ13535 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRQ13535 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRQ13535 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRQ13535 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRQ13535 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATRQ13535 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRQ13535 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRQ13535 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATRQ13535 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRQ13535 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRQ13535 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRQ13535 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRQ13535 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRQ13535 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRQ13535 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRQ13535 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRQ13535 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATRQ13535 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRQ13535 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRQ13535 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRQ13535 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRQ13535 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRQ13535 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRQ13535 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRQ13535 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRQ13535 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRQ13535 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRQ13535 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRQ13535 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRQ13535 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRQ13535 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRQ13535 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRQ13535 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRQ13535 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRQ13535 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRQ13535 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRQ13535 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRQ13535 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRQ13535 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRQ13535 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRQ13535 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRQ13535 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATRQ13535 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATRQ13535 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATRQ13535 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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