Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBB3Q13509 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB3Q13509 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBB3Q13509 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBB3Q13509 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
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