Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTM1Q13496 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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MTM1Q13496 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTM1Q13496 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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