Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTBP1Q13363 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTBP1Q13363 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTBP1Q13363 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
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