Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 MGAT4B-217ENST00000521305 1213 ntTSL 511.61□□□□□ -0.557e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ACD-205ENST00000602423 386 ntTSL 311.46□□□□□ -0.577e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 UBE2I-208ENST00000473256 1771 ntTSL 211.14□□□□□ -0.637e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 MGAT4B-222ENST00000523329 543 ntTSL 311.09□□□□□ -0.637e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.647e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ACD-211ENST00000602850 883 ntTSL 510.97□□□□□ -0.657e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.77e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ITPA-204ENST00000460550 967 ntTSL 210.37□□□□□ -0.757e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ELL-202ENST00000594635 4074 ntTSL 1 (best)10.28□□□□□ -0.767e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.787e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ITPA-208ENST00000483354 1028 ntTSL 310.16□□□□□ -0.787e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ACD-206ENST00000602519 997 ntTSL 210.12□□□□□ -0.797e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.827e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ITPA-209ENST00000490838 977 ntTSL 29.91□□□□□ -0.827e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ELL-204ENST00000596915 623 ntTSL 39.8□□□□□ -0.847e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ITPA-207ENST00000472295 670 ntTSL 29.25□□□□□ -0.937e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.937e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.937e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 RPS6KA3-202ENST00000438357 530 ntTSL 59.22□□□□□ -0.932e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 ITPA-206ENST00000461029 378 ntTSL 59.07□□□□□ -0.967e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 C2orf72-202ENST00000463834 3141 ntTSL 1 (best)8.9□□□□□ -0.987e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 TMEM120B-207ENST00000541467 2959 ntTSL 58.73□□□□□ -1.017e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 FAM118A-204ENST00000427777 521 ntTSL 48.64□□□□□ -1.037e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 UBE2I-211ENST00000564143 444 ntTSL 38.36□□□□□ -1.077e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 NFATC3-217ENST00000566893 715 ntTSL 27.84□□□□□ -1.157e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 FAT1-201ENST00000441802 14786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.187e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 NFATC3-204ENST00000379165 3583 ntTSL 27.57□□□□□ -1.27e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 C2orf72-203ENST00000477463 579 ntTSL 47.34□□□□□ -1.237e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 CEACAM1-212ENST00000488639 429 ntTSL 37.26□□□□□ -1.257e-6■■■□□ 18.9
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SRSF9Q13242 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.297e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 NFATC3-213ENST00000563319 4122 ntTSL 1 (best)6.89□□□□□ -1.317e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 NFATC3-208ENST00000553077 3870 ntTSL 26.77□□□□□ -1.327e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.377e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.47e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 AL390719.1-202ENST00000394517 397 ntTSL 56□□□□□ -1.457e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 NFATC3-220ENST00000569766 3555 ntTSL 1 (best)5.91□□□□□ -1.467e-6■■■□□ 18.9
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SRSF9Q13242 NFATC3-207ENST00000549350 3588 ntTSL 25.39□□□□□ -1.557e-6■■■□□ 18.9
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SRSF9Q13242 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.717e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.737e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.737e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 CEACAM1-211ENST00000485605 678 ntTSL 53.95□□□□□ -1.787e-6■■■□□ 18.9
SRSF9Q13242 TXNRD1-220ENST00000529751 557 ntTSL 410.82□□□□□ -0.682e-8■■■□□ 18.8
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SRSF9Q13242 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.82e-8■■■□□ 18.8
SRSF9Q13242 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.842e-8■■■□□ 18.8
SRSF9Q13242 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.892e-8■■■□□ 18.8
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SRSF9Q13242 TXNRD1-221ENST00000529784 607 ntTSL 48.46□□□□□ -1.062e-8■■■□□ 18.8
SRSF9Q13242 TXNRD1-217ENST00000527688 3858 ntTSL 28.36□□□□□ -1.072e-8■■■□□ 18.8
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SRSF9Q13242 ARIH2-218ENST00000474936 695 ntTSL 212.37□□□□□ -0.438e-7■■■□□ 18.7
SRSF9Q13242 ARIH2-204ENST00000433170 560 ntTSL 412.37□□□□□ -0.438e-7■■■□□ 18.7
SRSF9Q13242 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.588e-7■■■□□ 18.7
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SRSF9Q13242 ARIH2-224ENST00000486316 406 ntTSL 411.31□□□□□ -0.68e-7■■■□□ 18.7
SRSF9Q13242 ARIH2-230ENST00000495761 569 ntTSL 311.16□□□□□ -0.628e-7■■■□□ 18.7
SRSF9Q13242 ARIH2-228ENST00000492077 731 ntTSL 210.94□□□□□ -0.668e-7■■■□□ 18.7
SRSF9Q13242 ARIH2-219ENST00000478224 507 ntTSL 310.38□□□□□ -0.758e-7■■■□□ 18.7
SRSF9Q13242 ARIH2-206ENST00000449729 678 ntTSL 210.17□□□□□ -0.788e-7■■■□□ 18.7
SRSF9Q13242 ARIH2-208ENST00000452882 598 ntTSL 39.85□□□□□ -0.838e-7■■■□□ 18.7
SRSF9Q13242 ARIH2-231ENST00000498314 649 ntTSL 49.85□□□□□ -0.838e-7■■■□□ 18.7
SRSF9Q13242 ARIH2-203ENST00000430423 753 ntTSL 29.85□□□□□ -0.838e-7■■■□□ 18.7
SRSF9Q13242 ARIH2-221ENST00000482427 556 ntTSL 49.78□□□□□ -0.848e-7■■■□□ 18.7
SRSF9Q13242 ARIH2-217ENST00000474618 566 ntTSL 39.78□□□□□ -0.848e-7■■■□□ 18.7
SRSF9Q13242 ARIH2-222ENST00000483333 674 ntTSL 59.78□□□□□ -0.848e-7■■■□□ 18.7
SRSF9Q13242 ARIH2-201ENST00000356401 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.028e-7■■■□□ 18.7
SRSF9Q13242 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.072e-10■■■□□ 18.5
SRSF9Q13242 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.254e-8■■■□□ 18.5
SRSF9Q13242 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.514e-8■■■□□ 18.5
SRSF9Q13242 EEF1D-208ENST00000524883 828 ntTSL 211.45□□□□□ -0.582e-10■■■□□ 18.5
SRSF9Q13242 EEF1D-222ENST00000528519 553 ntTSL 39.95□□□□□ -0.822e-10■■■□□ 18.5
SRSF9Q13242 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.416e-7■■■□□ 18.4
SRSF9Q13242 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.696e-7■■■□□ 18.4
SRSF9Q13242 RAB17-206ENST00000414278 1511 ntTSL 210.27□□□□□ -0.776e-7■■■□□ 18.4
SRSF9Q13242 RAB17-202ENST00000392001 1792 ntTSL 1 (best)10.21□□□□□ -0.786e-7■■■□□ 18.4
SRSF9Q13242 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.816e-7■■■□□ 18.4
SRSF9Q13242 RAB17-205ENST00000411462 663 ntTSL 29.35□□□□□ -0.916e-7■■■□□ 18.4
SRSF9Q13242 RAB17-208ENST00000430445 421 ntTSL 58.55□□□□□ -1.046e-7■■■□□ 18.4
SRSF9Q13242 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.091e-7■■■□□ 18.3
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