Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NME3Q13232 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME3Q13232 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME3Q13232 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME3Q13232 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME3Q13232 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME3Q13232 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME3Q13232 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME3Q13232 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NME3Q13232 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME3Q13232 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME3Q13232 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NME3Q13232 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME3Q13232 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME3Q13232 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME3Q13232 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME3Q13232 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NME3Q13232 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME3Q13232 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME3Q13232 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME3Q13232 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NME3Q13232 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME3Q13232 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME3Q13232 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME3Q13232 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME3Q13232 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NME3Q13232 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME3Q13232 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME3Q13232 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME3Q13232 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NME3Q13232 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME3Q13232 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME3Q13232 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME3Q13232 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME3Q13232 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NME3Q13232 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME3Q13232 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME3Q13232 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME3Q13232 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME3Q13232 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME3Q13232 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NME3Q13232 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME3Q13232 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME3Q13232 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NME3Q13232 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME3Q13232 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME3Q13232 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME3Q13232 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NME3Q13232 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NME3Q13232 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME3Q13232 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NME3Q13232 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NME3Q13232 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NME3Q13232 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME3Q13232 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME3Q13232 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME3Q13232 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NME3Q13232 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME3Q13232 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME3Q13232 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NME3Q13232 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME3Q13232 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME3Q13232 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME3Q13232 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NME3Q13232 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME3Q13232 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME3Q13232 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME3Q13232 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME3Q13232 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NME3Q13232 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME3Q13232 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NME3Q13232 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME3Q13232 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME3Q13232 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME3Q13232 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME3Q13232 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NME3Q13232 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NME3Q13232 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME3Q13232 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME3Q13232 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME3Q13232 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME3Q13232 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NME3Q13232 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME3Q13232 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME3Q13232 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME3Q13232 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME3Q13232 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NME3Q13232 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NME3Q13232 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME3Q13232 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NME3Q13232 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NME3Q13232 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME3Q13232 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME3Q13232 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NME3Q13232 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NME3Q13232 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME3Q13232 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME3Q13232 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME3Q13232 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NME3Q13232 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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