Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RESTQ13127 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RESTQ13127 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RESTQ13127 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RESTQ13127 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
RESTQ13127 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RESTQ13127 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RESTQ13127 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RESTQ13127 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RESTQ13127 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RESTQ13127 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RESTQ13127 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RESTQ13127 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RESTQ13127 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RESTQ13127 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RESTQ13127 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RESTQ13127 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RESTQ13127 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RESTQ13127 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RESTQ13127 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RESTQ13127 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RESTQ13127 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RESTQ13127 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RESTQ13127 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RESTQ13127 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RESTQ13127 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RESTQ13127 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RESTQ13127 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RESTQ13127 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RESTQ13127 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RESTQ13127 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RESTQ13127 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RESTQ13127 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RESTQ13127 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RESTQ13127 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RESTQ13127 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RESTQ13127 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RESTQ13127 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RESTQ13127 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RESTQ13127 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RESTQ13127 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RESTQ13127 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RESTQ13127 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RESTQ13127 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RESTQ13127 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RESTQ13127 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RESTQ13127 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RESTQ13127 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
RESTQ13127 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RESTQ13127 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RESTQ13127 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RESTQ13127 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RESTQ13127 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RESTQ13127 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RESTQ13127 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RESTQ13127 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RESTQ13127 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RESTQ13127 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RESTQ13127 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RESTQ13127 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RESTQ13127 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RESTQ13127 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RESTQ13127 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RESTQ13127 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RESTQ13127 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RESTQ13127 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RESTQ13127 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RESTQ13127 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RESTQ13127 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RESTQ13127 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RESTQ13127 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RESTQ13127 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RESTQ13127 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RESTQ13127 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RESTQ13127 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RESTQ13127 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RESTQ13127 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RESTQ13127 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RESTQ13127 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RESTQ13127 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RESTQ13127 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RESTQ13127 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RESTQ13127 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RESTQ13127 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RESTQ13127 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RESTQ13127 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RESTQ13127 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RESTQ13127 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RESTQ13127 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RESTQ13127 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RESTQ13127 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RESTQ13127 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RESTQ13127 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RESTQ13127 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RESTQ13127 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RESTQ13127 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RESTQ13127 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RESTQ13127 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RESTQ13127 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RESTQ13127 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms