Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF3Q13114 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF3Q13114 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3Q13114 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3Q13114 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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