Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIK3Q13003 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIK3Q13003 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIK3Q13003 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
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