Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN31Q12999 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN31Q12999 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN31Q12999 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN31Q12999 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN31Q12999 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN31Q12999 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN31Q12999 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN31Q12999 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN31Q12999 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN31Q12999 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TSPAN31Q12999 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSPAN31Q12999 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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