Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF2Q12933 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF2Q12933 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF2Q12933 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms