Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYCNQ0VAF6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYCNQ0VAF6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms