Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LOXL1Q08397 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL1Q08397 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LOXL1Q08397 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms