Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DHX9Q08211 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DHX9Q08211 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms