Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF4Q08170 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRSF4Q08170 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRSF4Q08170 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms