Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFF3Q07654 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFF3Q07654 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms