Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 PUS4YNL292W 1212 nt5.95□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 PPM2YOL141W 2088 nt5.95□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 RBS1YDL189W 1374 nt5.94□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 ERG10YPL028W 1197 nt5.94□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 SML1YML058W 315 nt5.93□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 YNL017CYNL017C 339 nt5.93□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 OST3YOR085W 1053 nt5.93□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 SEC62YPL094C 825 nt5.93□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 YBR226CYBR226C 411 nt5.93□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 EDE1YBL047C 4146 nt5.93□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 CCC2YDR270W 3015 nt5.93□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 BUD9YGR041W 1644 nt5.92□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 UTR2YEL040W 1404 nt5.92□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 SLX5YDL013W 1860 nt5.92□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 ELP3YPL086C 1674 nt5.92□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 FBA1YKL060C 1080 nt5.92□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 MIA40YKL195W 1212 nt5.92□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 SMX3YPR182W 261 nt5.92□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 ICP55YER078C 1536 nt5.92□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 RAP1YNL216W 2484 nt5.91□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 CDC16YKL022C 2523 nt5.91□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 MPH3YJR160C 1809 nt5.91□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 YGL102CYGL102C 429 nt5.91□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 RRP46YGR095C 672 nt5.91□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 ICS3YJL077C 396 nt5.91□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 TIF2YJL138C 1188 nt5.91□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 DID2YKR035W-A 615 nt5.91□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 TIF1YKR059W 1188 nt5.91□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 MSC3YLR219W 2187 nt5.91□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 COQ1YBR003W 1422 nt5.91□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 GYP8YFL027C 1494 nt5.9□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 YIL055CYIL055C 1884 nt5.9□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 HED1YDR014W-A 489 nt5.9□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 YLR162WYLR162W 357 nt5.9□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 YLR312CYLR312C 1197 nt5.9□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 LGE1YPL055C 999 nt5.9□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 DOT1YDR440W 1749 nt5.9□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 EFT2YDR385W 2529 nt5.9□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 EFT1YOR133W 2529 nt5.9□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 RPP1YHR062C 882 nt5.89□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 AAD14YNL331C 1131 nt5.89□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 SPE3YPR069C 882 nt5.89□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 NUP49YGL172W 1419 nt5.89□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 BIO3YNR058W 1443 nt5.89□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 RIO1YOR119C 1455 nt5.89□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 YKL077WYKL077W 1179 nt5.88□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 ATG23YLR431C 1362 nt5.88□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 GDA1YEL042W 1557 nt5.88□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 POP1YNL221C 2628 nt5.87□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 SQT1YIR012W 1296 nt5.87□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 PEX13YLR191W 1161 nt5.87□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 KSH1YNL024C-A 219 nt5.87□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 TMA46YOR091W 1038 nt5.87□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 FIT2YOR382W 462 nt5.87□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 THI2YBR240C 1353 nt5.87□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 LAG2YOL025W 1983 nt5.87□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 ACS1YAL054C 2142 nt5.87□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 CRP1YHR146W 1398 nt5.86□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 REV7YIL139C 738 nt5.86□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 CIS3YJL158C 684 nt5.86□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 SWD1YAR003W 1281 nt5.86□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 LDB7YBL006C 543 nt5.86□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 SLD7YOR060C 774 nt5.86□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.86□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 IMA5YJL216C 1746 nt5.85□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 MSY1YPL097W 1479 nt5.85□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 YNL120CYNL120C 486 nt5.85□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 MRPL19YNL185C 477 nt5.85□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 YJL163CYJL163C 1668 nt5.85□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 PLB3YOL011W 2061 nt5.84□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 snR82snR82 268 nt5.84□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 GPI11YDR302W 660 nt5.84□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 YLR123CYLR123C 330 nt5.84□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 YOL046CYOL046C 675 nt5.84□□□□□ -1.47
SSK1Q07084 TPO3YPR156C 1869 nt5.83□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 YLL056CYLL056C 897 nt5.83□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 AVO2YMR068W 1281 nt5.83□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 YOR111WYOR111W 699 nt5.83□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 MOD5YOR274W 1287 nt5.83□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 PRY3YJL078C 2646 nt5.83□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 NTE1YML059C 5040 nt5.83□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 HXT15YDL245C 1704 nt5.82□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 HXT16YJR158W 1704 nt5.82□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 VPS61YDR136C 573 nt5.82□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 YGR127WYGR127W 939 nt5.82□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 COS6YGR295C 1146 nt5.82□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 GEF1YJR040W 2340 nt5.82□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 LDB19YOR322C 2457 nt5.82□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 GFA1YKL104C 2154 nt5.82□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 CSC1YLR241W 2349 nt5.81□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 PPM1YDR435C 987 nt5.81□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.81□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 RFC4YOL094C 972 nt5.81□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 MRPL23YOR150W 492 nt5.81□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 KEL1YHR158C 3495 nt5.8□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 HXK2YGL253W 1461 nt5.8□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 ENP1YBR247C 1452 nt5.8□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 YDR401WYDR401W 564 nt5.8□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 DUS4YLR405W 1104 nt5.8□□□□□ -1.48
SSK1Q07084 OGG1YML060W 1131 nt5.8□□□□□ -1.48
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