Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL18Q07020 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL18Q07020 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL18Q07020 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL18Q07020 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms