Protein–RNA interactions for Protein: Q05066

SRY, Sex-determining region Y protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRYQ05066 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRYQ05066 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SRYQ05066 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRYQ05066 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRYQ05066 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRYQ05066 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRYQ05066 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRYQ05066 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRYQ05066 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SRYQ05066 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRYQ05066 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRYQ05066 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRYQ05066 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRYQ05066 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRYQ05066 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRYQ05066 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRYQ05066 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRYQ05066 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRYQ05066 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRYQ05066 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRYQ05066 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRYQ05066 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRYQ05066 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRYQ05066 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRYQ05066 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRYQ05066 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRYQ05066 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRYQ05066 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRYQ05066 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRYQ05066 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRYQ05066 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SRYQ05066 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRYQ05066 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRYQ05066 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRYQ05066 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRYQ05066 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRYQ05066 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SRYQ05066 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRYQ05066 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRYQ05066 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRYQ05066 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRYQ05066 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRYQ05066 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRYQ05066 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRYQ05066 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRYQ05066 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRYQ05066 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRYQ05066 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRYQ05066 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRYQ05066 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRYQ05066 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRYQ05066 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRYQ05066 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SRYQ05066 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRYQ05066 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRYQ05066 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRYQ05066 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRYQ05066 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRYQ05066 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRYQ05066 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRYQ05066 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRYQ05066 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRYQ05066 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRYQ05066 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SRYQ05066 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRYQ05066 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRYQ05066 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRYQ05066 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRYQ05066 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRYQ05066 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRYQ05066 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRYQ05066 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRYQ05066 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRYQ05066 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRYQ05066 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRYQ05066 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRYQ05066 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRYQ05066 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRYQ05066 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SRYQ05066 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRYQ05066 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRYQ05066 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRYQ05066 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRYQ05066 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRYQ05066 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRYQ05066 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRYQ05066 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRYQ05066 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRYQ05066 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRYQ05066 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRYQ05066 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SRYQ05066 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRYQ05066 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRYQ05066 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRYQ05066 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRYQ05066 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRYQ05066 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SRYQ05066 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRYQ05066 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRYQ05066 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms