Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAV1Q03135 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAV1Q03135 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAV1Q03135 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAV1Q03135 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms