Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NHLH2Q02577 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NHLH2Q02577 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NHLH2Q02577 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms