Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFITM3Q01628 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFITM3Q01628 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFITM3Q01628 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFITM3Q01628 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IFITM3Q01628 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFITM3Q01628 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFITM3Q01628 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
IFITM3Q01628 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
IFITM3Q01628 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFITM3Q01628 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFITM3Q01628 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFITM3Q01628 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFITM3Q01628 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFITM3Q01628 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFITM3Q01628 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFITM3Q01628 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IFITM3Q01628 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IFITM3Q01628 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFITM3Q01628 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFITM3Q01628 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFITM3Q01628 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFITM3Q01628 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFITM3Q01628 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IFITM3Q01628 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFITM3Q01628 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFITM3Q01628 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IFITM3Q01628 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFITM3Q01628 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IFITM3Q01628 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFITM3Q01628 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IFITM3Q01628 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFITM3Q01628 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFITM3Q01628 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFITM3Q01628 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFITM3Q01628 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFITM3Q01628 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFITM3Q01628 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFITM3Q01628 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFITM3Q01628 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFITM3Q01628 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFITM3Q01628 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFITM3Q01628 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms