Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HMGCS1Q01581 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMGCS1Q01581 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMGCS1Q01581 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMGCS1Q01581 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms